Das Institut bietet die Aus- und Weiterbildung entsprechend der Ausbildungs- und Prüfungsordnung zum psychologischen und ärztlichen Psychotherapeuten (für Psychoanalyse und Tiefenpsychologie) an. Dazu gehören Theorie, klinische Seminare, Lehranalyse, Lehrtherapie und Supervision psychoanalytischer und tiefenpsychologischer Krankenbehandlung.
Ziel der Aus- und Weiterbildung ist die Befähigung zur selbstständigen Ausübung analytischer und/ oder tiefenpsychologisch fundierter Psychotherapie. Die Aus- und Weiterbildungsbestandteile werden durch die Lehranalytiker und Lehrtherapeuten sowie die Dozenten des Institutes für Psychotherapie und Angewandte Psychoanalyse e.V. Jena vermittelt.